11 марта - день, когда владыка Филарет вошел в число иерархов Русской православной церкви. В 1990 году в Москве состоялась его хиротония в епископы. С 28 декабря 2000 года, после смерти архиепископа Пензенского и Кузнецкого Серафима, Филарет возглавил местную епархию.
«Мы хорошо знали друг друга, вместе с архиепископом Серафимом работали преподавателями в духовной семинарии. Пензенская земля для меня не чужая, поэтому мне хочется принести пользу этому краю», - говорил епископ Пензенский и Кузнецкий преосвященный Филарет.
В одном из первых телеобращений к пензенской пастве в 2001 году преосвященный Филарет желал всем пензенцам обрести смысл жизни. Через четыре года владыка получил сан архиепископа.
С июля 2009-го Филарет находится на лечении в Москве. С сентября этого же года временным, а потом уже и постоянным управляющим Пензенской епархии был назначен епископ Люберецкий Вениамин.
В настоящий момент владыка Филарет официально числится епископом Русской православной церкви на покое.